年，战争阴霾日益浓厚，🔏蔡元培到南京，时任南🐅京政府行政🙲院长兼外交部长的汪精卫请他吃晚餐，用的是西膳。
蔡元培苦口婆心，劝汪精卫改变亲日立场，收敛亲日行为，表明严正态度，将抗战的国🉈🅘策确立不拔。
蔡元培说“关于📐🚀🐑中日的事情，我们应该坚定，应该以大🕳🍯无畏的精神抵🕲🍦抗，只要我们抵抗，中国一定有出路。”
话未说完，大家看到了这一幕激动的蔡元培眼泪夺眶而出滴到了酒杯中，他旋即端起那杯掺着泪水的酒，一饮而尽。举座的人见一这情景，无不动容，汪精卫则如坐针毡，🟏🜈⛰一时不知说什么好，尴尬之余只好顾左右而言他。
可惜，汪氏没能真正听得进🖏去，终于成为千古罪人。
年月日，在中研院评议会第二次年会上，蔡元培作了《中央研究院进行工作大纲》的☫报告，他要求研究院所属各研究所，加强武器原料和生产问题有关的课题研究，以适应抗战的需要。
他说“根据上次欧洲大战史之史实，吾人深知，凡科学发达之国家，🕲🍦皆可于应战时召集其国内作纯粹科学研究者，临时变作为国家军事技术服务😀♶之人，本院同人准备于如此机会之下，用其技术的能力，尽其国民的责任。在准备过程中，本院之个人及集体，自当随时应政府之需求，贡献其技术的能力。”
晚年的蔡元培，兼任了诸多教育界的社会职务，如中国公学董事长🝏🎐兼校董、上海法学院🉈🅘校董、上海美专校董兼主席、国立北平图书馆馆长、上海市图书馆临时董事会董事长、中华教育文化基金董事长兼董事、全国国语教育促进会会长、中国教育电影协会监事、故宫博物院理事长、北平孔德学校校长、爱国女学主席董事兼校董、中华职业教育社评议员、南通学院校董、苏州振华女学校董……??