第二日，有从吴郡招募的五百水军到了，周瑜亲自编师入队，发现其中有多人面色难看，精神萎靡，想可能是长途奔波，或者思念家乡，所以不急着让他们训练，先让他们适应军中生活，并且给他们的伙食安排得也相对好点。
可没过几日，传出死人的消息，这是一个新到的水军，周瑜亲自查看了尸体，皮肤表面出现大块紫色淤血，面色发黑，腹部鼓胀，死相很诡异。
周瑜盘问此人所从的伍长，此人怎么死的。
伍长告诉这人在途中就病了，来了军中后，因身上痛痛，又有些发热，以为他是感染了风寒，便让他在帐中休息，不想今日大家操练完回来，他身子突然打起寒战喊冷，但摸他身上却是火烫的，然后开始呕血，呼吸困难，突然就不行了。
周瑜觉得不寻常，命人去找军医张大夫，张大夫初步诊断为肺痨，叫人尽快把尸体火化，并把地上的血铲除，此人睡过的床铺和用过的行礼都一并烧毁，周瑜吩咐手下照张大夫的话办。
本以为这样就无事了，但没想过了几日，军中陆续有人病倒，起初都是身子发热，骨头酸痛，再捱几日，发展到咳血，便血的时候，也就死期将至了。
周瑜意识到问题的严重性，恐怕是遇到瘟疫，忙将军中所有有发兵症状的人与健康人分开隔离在不同的军帐，清点人数，居然有两千人有症状，这个触目惊心的数目让周瑜心惊胆战，而更坏的消息是，在没发病的人群中，每日也有人突然出现症状，被送往隔离点。
张大夫苦思冥想了好几日，熬了各种祖上流传下来防治瘟疫的中药给病人送去喝，但病情都没有得到缓解，情况依然在恶化，短短三日，就死了一百人。
面对这突如其来，猛如洪水的瘟疫，大夫无计可施，周瑜更是心急如焚。军中健康的士兵怕被传染，人人自危，甚至出现逃跑的情况。
周瑜立即下令死守军营，只准人进，不准人出。但凡发现有人逃跑，抓住斩首，上级军官也要受严厉军法。因为他很清楚，若有病人跑出去传染给百姓，事情会变得更加糟糕。
今日周瑜正在帐中苦闷的思索对策，张大夫不等通传，慌的乱跑进来，口中大叫着：“将军，将军，”停在帐中已气喘吁吁了。
周瑜紧张道：“张大夫，你这是有好消息，还是坏消息？”
“好···好消息有一个，还有一个坏消息。”
周瑜听得一头雾水，端了自己茶水走下来递给张大夫：“大夫请喝茶，慢慢说。”
张大夫接过来正准备喝，想了想，现在是非常时期，只把茶杯端在手上道：“将军，你可知道神医华佗吗？”
周瑜点点头道：“好似听过这个名字。”
“他是当今神医，有‘神农再世’的盛誉，游历天下，听说曾路过北方的一个村庄见过同样的病症，他在那村子呆了一年，研究出了治愈此瘟疫的法子。”张大夫兴奋道，更增加了所言的可信度。